很快明太子少保兼右军都督府左都督：达云、明陕西总镇巡抚：李徽猷，等将领就出奇兵设伏，击败蒙军，斩首六十五级，获牲畜上千只。
而松山堡大战之后，漠南蒙古河套各部们只能退居到贺兰山附近，还与青海蒙古诸部屡次联兵攻掠边境，尤其是以青海蒙古鞑靼土默特部首领：孛儿只斤·伊勒登代青（银定歹成）依旧桀骜不驯。
4月11日，户部上疏请令有司奉行一条鞭法，既酌量征收以充公费，不得佥派里长，挨月轮直，以滋苛刻。
1库役不许佥派民间富户充当。2不许于预备仓库佥编计级看管。3条鞭所载供应上官及过往使客，俱有定额，不许分外巧立富民、义民名色，借以供应。4条鞭夫马，岁有定额，输银在官，而雇役于民，不许遇夫马紧急，再于粮上重纳。5不许以保甲人户充迎送、色摄罪犯、打卯应差。6不许省祭义民充勾摄管工承委之役。7不许派民当行价值半给，支领衍期。8不许有司于罚赎之外，横肆科罪，折银充索。9征银不许粮甲串同保歇吏书任意侵没，征粮不许粮长串同吏书花户任意折乾，官收官解，则严禁火面。10通行江南直隶府州县，将一应田土查核见在户名，征粮之日，先行开派，定限收纳，拖欠者坐名查比，以免赔累。11凡内库之生绢、阔布，俱照光禄寺料银，供用库麻、蜡，改从官解。
这十一条在户部奏疏呈上后，得到明神宗：朱翊钧，的批准可其请颁行。
5月初7日，明神宗册封蜀府：朱奉爵，为隆昌郡王、唐府：朱器增，为宝庆郡王，益府：朱常漴，为安义郡王、朱由核嗣罗川郡王，周府：朱肃濛，嗣柘城郡王、朱肃溱嗣瑞金郡王、朱在预嗣鄢陵郡王。
同时明建州左卫军民指挥使：佟·努尔哈赤（爱新觉罗·努尔哈赤）带领族人迁都到赫图阿拉城，并设立了〈建州女真都督府〉。
6月28日，山东承宣布政使司济南府泰安州大水为灾，淹死男女八百余人，毁坏民舍数千区。
7月23日，京师大雨不断，保定府祁州、安肃县，两地同时连降暴雨，顷刻间水深一尺余，拔树折木、苗稼尽伤，其中祁州因为大水，田舍俱没城垣倒圯。
8月初4日，福建承宣布政使司泉州府（泉州卫）发生洪水，溺死万余人，毁坏民居不计其数，该府同安县还飓风大作，暴雨随至，海溢潮涌，冲坏民居、死人无数。
9月11日，江北地方及邻近各地布政司州府县，因灾伤重大，不断发生饥民造反事端。
因而有明凤阳行都督府漕运巡抚：李三才，称“近月来江北各处大风拔木，洪水滔天，饥民蜂起，南直隶徐州（徐州左卫）有赵古元造反、凤阳行都督府毫州（武平卫）有李大荣造反、河南承宣布政使司归德府睢州（睢阳卫）则有杨思敬造反！陛下每有征求，心说内府匮乏，其实不然，陛下所谓匮乏者，黄金未遍地，珠玉未满天而已。小民无食，重以征求，而且鞭挞无时，官惟丐罢、民惟请死。陛下毋谓臣祸乱之言为未必然，若已然，将置陛下于何地！”
但此疏呈上后，明神宗：朱翊钧，却置之不理。
11月初6日，明神宗命令户部拨给明福亲王：朱常洵，每年禄米一万石，今在京每年先支给三千石，大明通行宝钞一万贯，待正式到藩府之后，全数供给。
12月26日，明福亲王在京被明神宗选立女子：郭青雪，纳为侧妃，结为良缘共度一生。
明万历三十二年公元1604年正月18日，在帝都京城内发生一件浩浩荡荡的大喜事，乃是大明神宗万历显皇帝：朱翊钧，的皇三子明福恭亲王：朱常洵，举行的成亲仪式。
此次礼节规模庞大，明神宗还特意从户部开出30万两黄金，专门用来筹办这场隆重的婚礼。
席间最先到达的除了明神宗与明王皇后：王淑蓉，其次就是明皇太子：朱常洛，与各大附属国使者、都指挥使、总镇总兵、六部尚书、都察院，等文武官员们皆前来祝贺。
这次明建州左卫军民指挥使：佟·努尔哈赤，也发来贺礼，就连诸位亲王也率先赶来，郡王们纷纷把贺品交由礼部，就这样明福恭亲王与明恭亲王妃：郭青雪，就在京城举行婚礼。
6月11日，京畿顺天府昌平州大雨，浸坏了宗庙；明成祖燕王永乐文皇帝：朱棣，的「长陵」、明孝宗弘治敬皇帝：朱佑樘，的〈泰陵〉、明武宗正德毅皇帝：朱厚照，的（康陵）、明穆宗裕王隆庆庄皇帝：朱载垕，的［昭陵］，导致石渠及陵墙开裂。
至7月初1日，京城各地又连降大雨，续两月不止，外城正阳门、崇文门一带，城垣中陷者七十余丈，民居多坏。
明神宗遂发太仓库银十万两救济被水淹居户，而永平府、保定府、真定府各州县亦大雨不止，溺死男女无数。
9月10日，明户部尚书：赵世卿，奏报称“各镇下半年年例通该给发银一百五十七万八千余两，今查本库实在各项只有四千五百六十五两，无从给发，乞借发老库银若干