北魏在拓跋珪统治时期，针对当时的社会状况，为更好的治理国家实行了许多的措施，在众多措施中，比较独特的一项制度就是“子立母死”制度。如果后宫女子所生的儿子被选为了下一任统治者，为了避免后宫女子凭借自己的地位把持朝政，因此就要将选中的继承人的母亲杀死。虽然从表面上看，这种制度确实是将太后干预朝政的隐患给扼杀了，但是却也给北魏社会的发展造成了严重的影响。
引发了父子之间的矛盾冲突。
由于北魏建立时，人们的思想还受到母权社会时期的影响，加上人的本性就是对于母亲有一种依赖，所以北魏都是比较注重孝的，在加上继任的统治者都是出自于皇室，皇室的子孙很难享受到父爱，从他们出生开始，更多的还是获得的自己母亲的爱，所以他们对于母亲的感情都十分的深厚。
拓跋珪在制定“子立母死”制度的之后，第一位受到这项制度迫害的就是拓跋嗣的母亲刘贵人。当时拓跋珪选择继承人时，他选择了拓跋嗣，根据魏收在《魏书·道武七王列传》中记载，拓跋珪曾告诉拓跋嗣：“昔汉武帝将立其子而杀其母，不令妇人后与国政，使外家为乱。汝当继统，故吾远同汉武，为长久之计。”但是对于拓跋嗣来说，他对于母亲的感情十分深厚，他不愿意因为自己成为统治者而让母亲被赐死，所以后来拓跋嗣就偷偷地逃跑了。在最高统治者权力和利益的巨大诱惑之下，拓跋嗣都选择挽救自己的母亲而不选择统治者的位置，由此可见当时北魏皇室之中的亲情是更让他们所珍惜的。
拓跋嗣逃跑之后，拓跋珪就需要重新选择新的继承人，他选中了当时的次子清河王拓跋绍，按照“子立母死”的制度，拓跋绍的母亲贺夫人同样需要被刺死。虽然在众多历史资料中的记载里，拓跋绍本人是一个十分阴险，并且喜欢强取豪夺的人，但是他对于他的母亲却是十分的敬重。在得知拓跋珪要杀掉自己的母亲的时候，拓跋绍为了救自己的母亲，救带领着自己的亲信偷偷的潜入宫中，将拓跋珪给杀害了，并且自己登上了皇位。
拓跋嗣在听到拓跋绍杀死拓跋珪并且自己登上皇位的消息之后，又与城中自己的亲信里应外合，合力发动了兵变，将拓跋绍打败，平定了拓跋绍的叛乱，拓跋嗣由此登上了皇位，也就是北魏历史上的魏明帝。“子立母死”制度的制定给拓跋珪自己带来如此严重的后果，甚至搭上了自己的性命，相信这是拓跋珪没有想到的。拓跋珪去世的时候不过三十九岁，而他的次子拓跋绍死的时候才十六岁，由此可见，“子立母死”制度最先的受害者还是皇室的父子。
众多年轻嫔妃因此丧命。
虽然拓跋珪被人因为“子立母死”制度而丧命，但是这项制度却一直在北魏实行，因此在北魏历史上，因为此想制度而丧命的后宫嫔妃众多，比如太宗明元皇帝拓跋嗣母亲景穆皇后刘氏、世祖拓跋焘母亲明元密皇后杜氏、恭宗太武敬哀皇后贺氏等等，她们都是“子立母死”制度下的受害者。北魏历史上，只有到了统治末期时的最后一位太后得以幸免，但是此时的北魏也已经走到了历史最后的尽头。
北魏后期皇室子嗣严重减少。
在封建的男权社会时期，皇帝是可以拥有三宫六院，七十二嫔妃的，嫔妃之下还有众多的美人，她们年轻时可以凭借自己的美貌获得皇帝的宠爱，但是到了年老色衰的时候，所获得的荣华富贵只能依靠自己的儿子，也就是所谓的“母凭子贵”。所以我国古代社会中的皇室子孙一般都很多。如果自己所生的儿子能够登上皇位，那么自己就可以成为太后，更是成为全天下地位最高的女子，所以我国古代社会中，后宫嫔妃之间进行斗争，除了争宠之外，更多的还是想让自己的儿子登上皇位。
但是在北魏时期指定下“子立母死”制度之后，北魏的皇室子孙数量开始逐渐减少，到了后期更是少得可怜。根据魏收在《魏书·皇后列传》中记载当时后宫嫔妃“皆愿生诸王、公主，不愿生太子。”因为自己生的儿子一旦被立为太子，那么自己不但不能够凭借儿子尊贵的地位享受荣华富贵，还会使得自己因此丧命。所以当中后宫之中，许多的嫔妃都采取多种方法来避孕，很少主动的渴求生下皇子，这样就使得北魏的皇室血脉一度凋敝，“子立母死”制度下的弊端也充分地显现出来。
统治者的乳母或保姆借机干预政治。
拓跋珪制定“子立母死”制度的本意是保证皇权的统治，并避免大权旁落到外戚的手中，所以要将母族的主要凭借势力进行打击。但是，拓跋珪却忽略了一点，那就是由于选择继承人时，继承人的年龄相对较为幼小，还需要乳母或者保姆的抚养。在长期的抚养过程中，由于继承人年龄小，很容易就对于自己的乳母或保姆产生审核后的感情和依赖。在继承人登上皇位之后，也通常都会给予这些乳母或者保姆较高的地位，她们本来出身低微，是没有机会参与到朝政的，但是凭借与皇帝的深厚感情，她们也有了一定参与朝政的机会，这也为后来她们干预朝廷的政治统治提供了强有力的条件。