至于幻术忍者的部份，则主攻脑部细胞的蕴养，使精神能量渐渐地蜕变，最后透过精神能量开启眼、耳、鼻、舌、身、意的特殊能力，形成一种有别于精神能量的独特查克拉，其中最先开启也最为着名的便是眼睛的力量，因此也被称之为瞳力查克拉。
藉由这三种衍生出来的查克拉进行融合，使自身的查克拉成为三宝合一的查克拉，这才是忍者职业之所以能够成为中等文明，个体甚至可以进入高等文明层次的根本。
只不过凭借着这种后天演化出来的查克拉，想要突破那道门槛晋阶史诗却十分地困难，远远不及利用自然能量形成仙术查克拉并构筑所谓的仙人体，以及利用异种查克拉所构筑的专属查克拉的忍者晋阶史诗的机率高，但却是二次元宇宙当前最为主流的修行方式。